حکومت حضرت مهدى عليه السلام از نوع «حکومت ولايي» است که همه مسئوليتها و قدرتها در شخص امام متمرکز است؛ امام عليه السلام براى ايالتها و استانهاى مختلف، استاندار و فرماندار منصوب ميکند و در هر منطقه، انجام تمام امور حکومتى از جمله قضاوت، فرماندهى، برقرارى امنيت، دفاع از جان و مال و ناموس مردم، رسيدگى به فقرا، برطرف کردن مشکلات مردم، آبادسازى و . . . ــ درست به شيوهى حکومت حضرت على عليه السلام- به عهده حاکم و فرماندار آن منطقه است.
در حديثى از امام باقر عليه السلام آمده است که حضرت مهدى عليه السلام پس از شکست سفيانى و تحويل گرفتن عدهاى از بنى اميه که به روميان پناهنده شدهاند، به کوفه باز ميگردد؛ آن گاه به سينه و پشت ياران خود که تعدادشان اندکى بيش از سيصد و ده نفر است دست ميکشد و آنان را به سرزمينهاى مختلف اعزام ميفرمايد.